Con el fin de conservar y preservar el liderazgo académico y el reconocimiento nacional e internacional en la generación de conocimiento, El Colegio de México creó en 2017 un Fondo para apoyar la investigación de su personal académico. Este Fondo se constituyó con una donación para este propósito y se complementó con un apoyo financiero de la Fundación Colmex. A futuro se planea mantener el esquema combinado de donaciones y aportaciones de la Fundación. Debido a la pandemia, en 2020 no se publicó convocatoria, pero los proyectos de investigación vigentes continuaron sus actividades y un proyecto fue finalizado. Se planea abrir la convocatoria nuevamente en 2021.